Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNA3Q9UI47 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms