Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms