Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EHD2Q9NZN4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EHD2Q9NZN4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EHD2Q9NZN4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EHD2Q9NZN4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EHD2Q9NZN4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EHD2Q9NZN4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms