Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms