Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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