Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1Q9HAT0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms