Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NLRP1Q9C000 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms