Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms