Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.9 ms