Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms