Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PKP4Q99569 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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