Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms