Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM43Q96BQ3 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms