Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms