Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms