Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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