Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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