Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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