Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms