Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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