Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBR1LQ6UX01 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms