Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A4Q6AI14 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms