Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms