Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms