Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUM3Q15397 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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