Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE3CQ15386 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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UBE3CQ15386 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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UBE3CQ15386 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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