Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CHD4Q14839 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CHD4Q14839 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CHD4Q14839 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CHD4Q14839 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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