Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms