Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTTNQ14247 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms