Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DDX39BQ13838 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DDX39BQ13838 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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