Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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