Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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