Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDE4DQ08499 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms