Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms