Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S1P61966 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S1P61966 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP1S1P61966 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms