Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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