Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEC13P55735 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC13P55735 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC13P55735 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC13P55735 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC13P55735 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC13P55735 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC13P55735 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC13P55735 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEC13P55735 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms