Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSC2P49815 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSC2P49815 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSC2P49815 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSC2P49815 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSC2P49815 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSC2P49815 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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