Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRXP46100 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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