Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GDF5P43026 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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