Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXD12P35452 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXD12P35452 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms