Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA10P31260 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms