Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPRMP28827 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRMP28827 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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