Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms