Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF2RAP15509 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms