Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT10P13645 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT10P13645 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT10P13645 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT10P13645 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT10P13645 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT10P13645 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT10P13645 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT10P13645 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT10P13645 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT10P13645 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT10P13645 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT10P13645 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms