Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms