Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM228BP0C875 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms