Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APODP05090 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
APODP05090 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.4 ms