Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNDBP1O95273 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms